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胡懿娟教授学术讲座在我院顺利举办

发布者:侍夏芳发布时间:2023-06-03浏览次数:10

   (通讯员:张皓雅)2023年6月2日上午10:00,统计与数学学院主办的从Integrative analysis of 16S marker-gene and shotgun metagenomic sequencing data improves efficiency of testing microbiome hypotheses学术讲座在文波楼201智慧教室成功举办,本次讲座由美国艾默里(Emory)公共卫生学院生物统计与生物信息系胡懿娟教授主讲,学院吴远山教授主持,学院部分老师与研究生都积极参加了此次讲座。

   本次讲座说明在分析微生物群落时最广泛使用的技术是 16S marker-gene sequencing和 shotgun metagenomic sequencing。目前许多微生物组研究对同一组样本进行了两项实验。这两个数据集经常产生一致的分类模式,突出了综合分析的潜力,以提高测试这些模式的能力。但存在每个数据集都受到明显的实验偏差的影响的问题,这些偏差以特定于实验的方式系统地扭曲了测量值。然而,每个数据集都受到不同的实验偏差的影响,这些偏差会以特定于实验的方式系统地扭曲实际值的测量值。这些实验偏差,加上两个数据集之间部分重叠的样本和不同的库大小,在组合数据集时带来了巨大的挑战。

   讲座针对这个问题给出一些解决方法,胡教授介绍了用于此类综合分析的第一种方法,名为 LOCOM-I。该模型采用逻辑回归来测试分类单元的差异丰度,同时保持对实验偏差的鲁棒性。新方法将两个实验的数据结合起来进行差异丰度测试,同时考虑差异实验偏差,为每个观察值分配自适应权重,并适应某个实验特有的样本和分类群。通过大量的仿真研究证明了新方法的一致优越性。

   讲座的最后,吴远山老师鼓励同学们积极提问,并且与教授沟通交流,对此次的获得的新知识加深印象与结合实践。本次学术讲座举办成功,推进学生们对前沿知识与研究成果有了更近一步的了解,开阔了一些新的研究思路与方向,提供了一个开阔学术视野、了解学术前沿资讯的平台。